推出的几款新型药物而广受好评,?同时,?在地下社会,?乌丸集团的身影开始悄然淡去，渐渐隐于幕后。就连赤井秀一这种经验老道，追查组织已久的FBI,?在意识到不对劲的时候,?才发现木已成舟,?没等他深入调查，组织就在一夜之间消失，留下的至于稀稀落落的几个空壳和几个站点，被公安一举清剿。
乌丸集团就此陷落，像基安蒂这样的不少高层干部被逮捕,?其它来自各方的卧底公开身份时成功脱身，贝尔摩德一如既地游走在灰色的地带难以捕捉,?女明星莎朗却一如既往活跃于荧幕上，波本的卧底身份到最终也没有公布，不少人猜测这个神秘主义者早已隐居或者逃亡国外，谁也不知道他从未脱下过身上的警服,?至于突然出现的神秘人物,?诸如新任的boss以及军师“教父”和护卫“白兰地”则来无影去无踪,?仿佛人间蒸发一样就此消失，出现在大众视野中的只有女承父业，致力于开发研究药物救济天下的酒厂制药公司董事长藤丸立香，以及为了兑现对挚友的承诺特地从国外赶回来教导她的教父,?目前掌握大部分实权，对教女宠爱有加的总经理詹姆斯。
就连公安中的不少人也觉得似乎有些意料之外的轻松，但再一考虑此前漫长的追查工作和大大小小的战役，以及潜入组织多年的卧底，顿时觉得一切都像是水到渠成一般的顺利，干脆就不再想太多。而降谷零则遵守约定，没有将藤丸立香等人的消息传出去，于是这个故事就变成了“组织的boss假死意图转移组织却被卧底公安看出并且用计假戏真做消灭boss后依据拿下组织”的故事。
在降谷零的配合下，莫里亚蒂把一切证据做得滴水不漏，大部分普通的、还没有变得丧心病狂的科研人员都进入了公司研究能够救人的药物，很多愿意改邪归正的成员也在莫里亚蒂稍稍对他们进行了一些小催眠之后也进入了公司开始了平凡的工作，当然也留下了一些武装力量以保证未来公司不会被地下社会的其它东西威胁，贝尔摩德也依旧为制药公司效力，让公司不至于因为一点黑暗的小尾巴而被黑吃黑。
灰原哀在藤丸立香的劝说下，还是答应了进入公司进行研究，藤丸立香也耿直地把APTX-4869相关的资料全都交给了她，让她去研发恢复的药物。至于柯南，也开始暗暗为“柯南”这个人物如何消失得不起眼而作准备。
而藤丸立香也收到了“安室透”最后的邀约。
“你居然真的完全没有说出去啊。”在夜晚空无一人的波洛咖啡厅，藤丸立香对着柜台内正在收拾的安室透感慨道，“我还以为降谷零会是那种一定会把自己所知道的部分如实上报的那种警员呢。”
“降谷零也不是傻子好吗。”安室透笑了笑，回答道，“我知道，这是最好的选择了，最少的流血，最少的损失，最少的混乱和动荡，对于这个国家来说——我本来就不是为了上司在工作，而是为了国家啊。”
“出人意料是完全不死板的类型呢！”藤丸立香喝了一口他递过来的饮料，眨眨眼，“咦，这是什么饮料？”
“是灰姑娘，一款经典的无酒精鸡尾‘酒’。”安室透解释说，“考虑道你还没到能喝酒的年纪，我可不想被你的伯爵给烧死。”
“哈、哈哈，不至于的……”藤丸立香干笑了两声。
“这种鸡尾酒最初的含义是告诉年轻的女孩子们‘如果不能喝酒，就不要去参加舞会’。”安室透用毛巾擦擦手，靠到柜台边来，“虽然很想这么对你说，但你已经踏入其中，我也就没有办法了。”
“谢谢关心，但我不要紧的。”藤丸立香点了点头，“不过无酒精鸡尾酒啊，会有酒的味道吗？”
“其实就是果汁而已。”安室透给自己也拿出一个杯子，不知道从哪摸出一瓶酒来给自己倒上。“那个是酒吧？”藤丸立香闻出了酒的气味，“波本？”
“是苏格兰威士忌。”安室透耸耸肩，重新把酒瓶盖上然后开始小口喝着杯子里棕红的酒液。
“这样啊……”藤丸立香停顿了一下，然后抬起自己的杯子，“那我们来干杯吧！”
“为什么？”几天前就参加过庆祝剿灭组织的庆功会的安室透好笑地看着眼前稚气未脱的少女，“为了酒厂制药公司的成立？”
“不，为了波本！”藤丸立香固执地举着杯子，“谢谢你这段时间的照顾啦，波本先生~”
“……噗。”安室透控制不住地笑了起来，“什么啊，该道谢的是我吧。”
“那就更要干杯啦，快点举起杯子喂！”藤丸立香催促道，“你已经辞职了对吧——那么现在就是最后的机会了噢，波本先生！这是boss的命令！”
“好好，听你的。”安室透无奈地也举起杯。
“敬波本。”藤丸立香笑着，眼底流露点点星光。
“也敬你，boss。”两人的杯子轻轻碰上，发出清脆的一声。
然后藤丸立香咕嘟咕嘟喝了一大口冰镇的饮料，然后喘了口气：“呼呼呼，好舒服！”
安室透看着她的在